시계열자료의 분석에 단위근과 공적분이론을 적용하게 되면서 관련변수들 간 장기적 관계의 구조변화 가능성에 대한 관심이 증폭되었다. 그간 경제환경의 변화로 주식․실물․외환․금융시장간 장기균형체계에 구조변화 발생 가능성이 존재하며, 이 경우 시간불변을 가정하는 기존의 공적분검정은 신뢰하기 어렵다. 본 연구는 시간불변과 가변적 관점에서 주식시장 변동체계의 장기적 역학관계와 변동성향 및 안정성에 대해 통계적으로 규명해 보았다. 분석모형에서 내생적으로 구조변환점을 결정하는 공적분검정은 주식시장 변동체계의 장기균형이 일정 기간 유지되다가 새로운 균형관계로 이동한 것으로 추정한다. 이러한 구조변화의 성향을 파악하기 위해 시변공적분모수의 가설검정 결과 장기균형은 안정적이지만 약한 임의보행 과정을 보여 시간가변 성향이 존재하는 것으로 나타났다. 단기조정을 병행한 통계적 검정을 추가로 실시한 결과 장기균형은 안정적이지만 단기조정 벡터가 급변하는 불안정성이 존재하는 것으로 검색되었다. 따라서 국내 증시 변동체계의 역학관계에 대한 통계적 검정들은 모두 장기적 안정성이 유지되는 가운데 시간가변 성향이 존재한다는 일관된 결과를 보이는 것으로 판명되었다.